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141.Imagem marcado/desmarcadoMELO, R. C.; RIBEIRO, C.; MURRAY, C. S.; VELOSO, C. J. M.; SILVEIRA, C. H. da; NESHICH, G.; MEIRA JUNIOR, W.; CARCERONI, R. L.; SANTORO, M. M. Finding protein-protein interaction patterns by contact map matching. Genetics and Molecular Research, v. 6, n. 4, p. 946-963, 2007.

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142.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; BAUDET, C.; FREITAS, E. M. de; SANTOS, G. F. dos; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Experiência de utilização de XML no SMS. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2002. 7 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 32). Na publicação: Paula Kuser Falcão.

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143.Imagem marcado/desmarcadoNARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G.; FALCAO, P.; HENRIQUE, E.; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I. Transformação de imagens 3D para 2D para análise de proteínas usando o software Sting. In: CONGRESSO DE COMPUTAÇÃO DO SUL DE MATO GROSSO, 2., 2006, Rondonópolis. Computação e educação: anais. Rondonópolis: UFMT, 2006. p. 176-184. COMPSULMT 2006.

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144.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; BAUDET, C.; MANCINI, A. L.; MATTIUZ, A. R.; FREITAS, E. M. de; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. SMSLib - biblioteca C++ do Sting Millennium Suite. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2002. 10 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 39). Na publicação: Paula Kuser Falcão.

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145.Imagem marcado/desmarcadoBEZERRA, I. C.; ALMEIDA, E. R. P. de; CASTRO, L. A. B. de; NESHICH, G.; VALLE, M.; MONTE-NESHICH, D. de C. Two globulin isoforms codified by a single precursor gene from taro (Colocasia esculenta L.). In: ENCONTRO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA VEGETAL, 1., 1993, Brasilia.Programa e resumos. Brasilia: EMBRAPA-CENARGEN, 1993. Poster 011. Resumo

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146.Imagem marcado/desmarcadoBRANDÃO, M. M.; ARRUDA, L. H.; NESHICH, G.; NESHICH, I. P.; PEREIRA, J. G. C.; MALAGÓ JÚNIOR, W.; SILVA-FILHO, M. C. Structural and phylogenetic analysis of Spodoptera frugiperda chymotrypsins involved on insect chemical protective barrier against plant Proteinase Inhibitors (PIs). In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 40., 2011, Foz do Iguaçu. [Proceedings...]. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Não paginado.

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147.Imagem marcado/desmarcadoMANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; CECILIO, P. L.; PELLIGRINELLI, T. V.; NESHICH, G. Structure descriptors of chameleon sequences. In: RED IBEROAMERICANA DE BIOINFORMÁTICA CONGRESS, 5., 2008, Chile. Program and abstracts... Santiago: Pontificia Universidad Católica de Chile, 2008. Não paginado. RIB 2008.

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148.Imagem marcado/desmarcadoMANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, A.; DOMINIQUINI, F.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G. Sting contacts: a web-based application for identification and analysis of amino acid contacts within protein structure and across protein interfaces. Bioinformatics, v. 20, n. 13, p. 2145-2147, 2004. Na publicação: P. R. Kuser.

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149.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, G.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; JARDINE, J. G.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; NESHICH, I. A. P.; PEREIRA, J. G. C. STING_LDA_PIP - STING: Linear discriminate analysis with cross-validation for protein interface prediction. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.

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150.Imagem marcado/desmarcadoMORAES, F. R. de; VILLANUEVA, W. J. P.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; NISHIMURA, L.; SALIM, J. A.; JARDINE, J. G.; VON ZUBEN, F.; NESHICH, G. SIPEPPI, a systematic neuron network-based methodology for predicting protein-protein interfaces using STING database descriptors. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 40., 2011, Foz do Iguaçu. [Proceedings...]. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Não paginado.

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151.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. C. M. da; TEIXEIRA, F. R.; CRUZ, C. C. M. da; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G.; SA, M. F. G. de. In vitro molecular evolution of bean alpha-amylase inhibitors to investigate specificity of binding to alpha-amylases. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. [Proceedings...]. Detroit: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster LB-28.

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152.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, G.; NESHICH, I. A. P.; MORAES, F.; SALIM, J. A.; BORRO, L.; YANO, I. H.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; ROCCHIA, W. Using structural and physical-chemical parameters to identify, classify, and predict functional districts in proteins-the role of electrostatic potential. In: ROCCHIA, W.; SPAGNUOLO, M. (Ed.). Computational electrostatics for biological applications: geometric and numerical approaches to the description of electrostatic interaction between macromolecules. Cham: Springer, 2015. Chapter 12. p. 227-254.

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153.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; MARANGONI, S.; MARTINS, D.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; MANCINI, A.; NESHICH, G.; JARDINE, J. G. Xylella fastidiosa hexameric pilus retraction motor PILT interfaces are maintained by non-hydrophobic contacts. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.

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154.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; BORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. de M.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; NESHICH, G. Analysing protein-protein interface using JPIV. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-14. Na publicação: Paula R. Kuser-Falcão, Stanley R. M. Oliveira, Edgard H. Santos.

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155.Imagem marcado/desmarcadoRIBEIRO, C.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MINARDI, R. C. de M.; SILVEIRA, C. H. da; JARDINE, J. G.; SANTORO, M. M.; NESHICH, G. Analysis of binding properties and specificity through identification of the interface forming residues (IFR) for serine proteases in silico docked to different inhibitors. BMC Structural Biology, London, v. 10, n. 36, p. 1-16, 2010.

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156.Imagem marcado/desmarcadoRIBEIRO; TOGAWA, R. C.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MINARDI, R. C. de M.; SILVEIRA, C. H. da; JARDINE, J. G.; SANTORO, M. M.; NESHICH, G. Analysis of binding properties and specificity through identification of the interface forming residues (IFR) for serine proteases in silico docked to different inhibitors. BMC Structural Biology, London, v. 10, n. 36, p. 1-16, 2010. Disponível em:.Acesso em: 5 jan. 2011.

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157.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Identificando Pockets na superfície protéica usando o Java Protein Dossier - JPD. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2005. 4 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 67).

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158.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, C. M. Y.; MORAES, F. R. de; NESHICH, G.; MOREIRA, E. C. de O.; COSTA, C. de N. M.; SANTOS, R. C. dos; SOUZA, C. R. B. de. Identification of cDNA sequences coding for bZIP regulatory proteins predicted to interact with putative cis-acting elements from Be2S1 gene. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Forlaleza. Programas e resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 212-213. Congresso da SBBiotec 2010.

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159.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; BORRO, L. C.; SANTOS, E. H.; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; KUSER-FALCÃO, P. R.; NESHICH, G. Predicting enzyme class from protein structural parameters and bagging predictors. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-13.

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160.Imagem marcado/desmarcadoBORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; NESHICH, G. Predicting enzyme class from protein structure using Bayesian classification. Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 1, p. 193-202, 2006.

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141.Imagem marcado/desmarcadoMANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; CECILIO, P. L.; PELLIGRINELLI, T. V.; NESHICH, G. Structure descriptors of chameleon sequences. In: RED IBEROAMERICANA DE BIOINFORMÁTICA CONGRESS, 5., 2008, Chile. Program and abstracts... Santiago: Pontificia Universidad Católica de Chile, 2008. Não paginado. RIB 2008.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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142.Imagem marcado/desmarcadoMANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, A.; DOMINIQUINI, F.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G. Sting contacts: a web-based application for identification and analysis of amino acid contacts within protein structure and across protein interfaces. Bioinformatics, v. 20, n. 13, p. 2145-2147, 2004. Na publicação: P. R. Kuser.
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143.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, G.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; JARDINE, J. G.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; NESHICH, I. A. P.; PEREIRA, J. G. C. STING_LDA_PIP - STING: Linear discriminate analysis with cross-validation for protein interface prediction. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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144.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; BAUDET, C.; MANCINI, A. L.; MATTIUZ, A. R.; FREITAS, E. M. de; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. SMSLib - biblioteca C++ do Sting Millennium Suite. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2002. 10 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 39). Na publicação: Paula Kuser Falcão.
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145.Imagem marcado/desmarcadoNARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G.; FALCAO, P.; HENRIQUE, E.; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I. Transformação de imagens 3D para 2D para análise de proteínas usando o software Sting. In: CONGRESSO DE COMPUTAÇÃO DO SUL DE MATO GROSSO, 2., 2006, Rondonópolis. Computação e educação: anais. Rondonópolis: UFMT, 2006. p. 176-184. COMPSULMT 2006.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
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146.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, G.; NESHICH, I. A. P.; MORAES, F.; SALIM, J. A.; BORRO, L.; YANO, I. H.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; ROCCHIA, W. Using structural and physical-chemical parameters to identify, classify, and predict functional districts in proteins-the role of electrostatic potential. In: ROCCHIA, W.; SPAGNUOLO, M. (Ed.). Computational electrostatics for biological applications: geometric and numerical approaches to the description of electrostatic interaction between macromolecules. Cham: Springer, 2015. Chapter 12. p. 227-254.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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147.Imagem marcado/desmarcadoBEZERRA, I. C.; ALMEIDA, E. R. P. de; CASTRO, L. A. B. de; NESHICH, G.; VALLE, M.; MONTE-NESHICH, D. de C. Two globulin isoforms codified by a single precursor gene from taro (Colocasia esculenta L.). In: ENCONTRO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA VEGETAL, 1., 1993, Brasilia.Programa e resumos. Brasilia: EMBRAPA-CENARGEN, 1993. Poster 011. Resumo
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148.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. C. M. da; TEIXEIRA, F. R.; CRUZ, C. C. M. da; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G.; SA, M. F. G. de. In vitro molecular evolution of bean alpha-amylase inhibitors to investigate specificity of binding to alpha-amylases. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. [Proceedings...]. Detroit: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster LB-28.
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149.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; MARANGONI, S.; MARTINS, D.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; MANCINI, A.; NESHICH, G.; JARDINE, J. G. Xylella fastidiosa hexameric pilus retraction motor PILT interfaces are maintained by non-hydrophobic contacts. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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150.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; BORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. de M.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; NESHICH, G. Analysing protein-protein interface using JPIV. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-14. Na publicação: Paula R. Kuser-Falcão, Stanley R. M. Oliveira, Edgard H. Santos.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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151.Imagem marcado/desmarcadoRIBEIRO, C.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MINARDI, R. C. de M.; SILVEIRA, C. H. da; JARDINE, J. G.; SANTORO, M. M.; NESHICH, G. Analysis of binding properties and specificity through identification of the interface forming residues (IFR) for serine proteases in silico docked to different inhibitors. BMC Structural Biology, London, v. 10, n. 36, p. 1-16, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
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152.Imagem marcado/desmarcadoRIBEIRO; TOGAWA, R. C.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MINARDI, R. C. de M.; SILVEIRA, C. H. da; JARDINE, J. G.; SANTORO, M. M.; NESHICH, G. Analysis of binding properties and specificity through identification of the interface forming residues (IFR) for serine proteases in silico docked to different inhibitors. BMC Structural Biology, London, v. 10, n. 36, p. 1-16, 2010. Disponível em:.Acesso em: 5 jan. 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
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153.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B. da; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FILETO, R.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Building multiple sequence alignments with a flavor of HSSP alignments. Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 1, p. 127-137, 2006.
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154.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; OLIVEIRA, A. G.; HORITA, L. G.; MIURA, R. T.; INOUE, M. K.; FALCAO, P. R. K.; MANCINI, A. L.; YAMAGISHI, M. E. B.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G. Defining 3D residue environment in protein structures using SCORPION and FORMIGA. Bioinformatics, v. 20, n. 12, p. 1989-1991, 2004. Na publicação: P. R. Kuser.
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155.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; MONTAGNER, A. J.; TOGAWA, R. C.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; PAPPAS JUNIOR, G.; MIURA, R. T.; HORITA, L. G.; NESHICH, G. ConSSeq: a web-based application for analysis of amino acid conservation based on HSSP database and within context of structure. Bioinformatics, v. 20, n. 12, p. 1983-1985, 2004. Na publicação: P. R. Kuser.
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156.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; NISHIMURA, L.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; VILLALTA-ROMERO, F.; BORRO, L.; YANO, I. H.; MAZONI, I.; TASIC, L.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Computational Biology tools for identifying specific ligand binding residues for novel agrochemical and drug design. Current Protein and Peptide Science, v. 16, n. 8, p. 701-717, 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
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157.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; BORRO, L. C.; SANTOS, E. H.; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; KUSER-FALCÃO, P. R.; NESHICH, G. Predicting enzyme class from protein structural parameters and bagging predictors. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-13.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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159.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Identificando Pockets na superfície protéica usando o Java Protein Dossier - JPD. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2005. 4 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 67).
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160.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, C. M. Y.; MORAES, F. R. de; NESHICH, G.; MOREIRA, E. C. de O.; COSTA, C. de N. M.; SANTOS, R. C. dos; SOUZA, C. R. B. de. Identification of cDNA sequences coding for bZIP regulatory proteins predicted to interact with putative cis-acting elements from Be2S1 gene. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Forlaleza. Programas e resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 212-213. Congresso da SBBiotec 2010.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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